摘要
摘要目的利用生物信息学鉴别与食管鳞癌预后及免疫相关的长链非编码RNA(lncRNA)，并构建预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载食管鳞癌患者的转录组数据及临床资料。从分子数据库得到免疫基因，与转录组数据取交集得到免疫相关基因。使用相关性分析得到免疫相关lncRNA。通过单因素COX分析获得与预后相关的免疫lncRNA。依据这些lncRNAs在样本中的表达量，构建COX预后风险评分模型，计算风险值。依据风险值，区分出高低风险组。通过受试者工作特征曲线(ROC)比较曲线下面积，评估模型的有效性。结果从TCGA数据库下载得到95例食管鳞癌样本，免疫基因与转录组数据取交集得到免疫相关的基因331个。通过相关性分析和单因素COX分析得到6个显著与预后相关的免疫lncRNA(分别为LINC02159、AC092484.1、AC099850.3、AC125807.2、AC105277.1和AC037459.3)，并构建基于这6个lncRNA的预后风险模型，依据患者的风险值，以中位数为临界点，将患者分为高低风险组。通过生存分析比较5年生存率，发现高风险组的生存率显著低于低风险组(P<0.01)。ROC曲线结果表明曲线下面积(AUC)为0.844。结论免疫预后相关lncRNA可以预测食管鳞癌患者的预后，并为食管鳞癌免疫相关lncRNA研究及治疗提供线索。
出版日期
2021年09月05日（中国Betway体育网页登陆平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
